Populaire Berichten

Editor'S Choice - 2019

Antibioticaresistentiegenen zijn vrijwel overal

Anonim

De grootste metagenomische zoektocht naar antibioticaresistentiegenen in de DNA-sequenties van microbiële gemeenschappen uit de hele wereld heeft aangetoond dat bacteriën die deze vervelende genen dragen overal in de natuur opduiken waar wetenschappers naar zoeken. De bevindingen die in het Cell Press-tijdschrift Current Biology op 8 mei werden gepubliceerd, voegen toe aan bewijs dat aantoont hoe algemeen en overvloedig die resistentiegenen echt in natuurlijke omgevingen zijn.

advertentie


Deze grootschalige, ecologische kijk op een groeiend zorgvraagstuk benadrukt de belangrijke relatie tussen antibioticaresistentie in de kliniek en omgevingsmicrobiologie, zeggen de onderzoekers.

"Hoewel bekend is dat de omgeving antibioticaresistente bacteriestammen bevat, zoals vele eerdere studies hebben aangetoond, wisten we niet echt hoe groot ze waren", zegt Joseph Nesme van de Université de Lyon in Frankrijk. "Het feit dat we antibioticaresistentiegenen in relatief belangrijke hoeveelheden in elke geteste omgeving konden detecteren, is zeker ons meest opvallende resultaat."

De onderzoekers, waaronder Nesme en senior auteur van de studie Pascal Simonet, profiteerden van de steeds groter wordende hoeveelheden bestaande sequentiegegevens van de volgende generatie die vrij beschikbaar zijn in openbare repositories, samen met informatie over antibioticumresistentiegenen die worden aangetroffen in pathogenen die patiënten infecteren in de kliniek.

"Onze strategie was simpelweg om al deze reeds bestaande gegevens te gebruiken en te combineren om nauwkeuriger te antwoorden op de kwestie van antibioticaresistentieprevalentie in de omgeving", zegt Nesme.

De analyses van de wetenschappers detecteerden de determinanten van het antibioticaresistentiegen in alle 71 omgevingen die in de openbare gegevens zijn vertegenwoordigd, waaronder bodem, oceanen en uitwerpselen van de mens. Monsters verzameld uit de bodem bevatten de meest diverse pool van resistentiegenen, vonden de auteurs. De meest voorkomende typen blootgestelde resistentie waren effluxpompen en andere genen die resistentie verlenen tegen vancomycine, tetracycline of bètalactamantibiotica, die algemeen worden gebruikt in de veterinaire en menselijke gezondheidszorg.

Dit alles, en Simonet zegt dat ze weten dat de technologieën van vandaag nog steeds niet in staat zijn om alle diversiteit in de omgeving te vangen. Met andere woorden, we missen nog steeds een deel van de foto.

Er is een zeer goede reden dat microben bewapend zijn met antibioticaresistentiegenen, leggen de onderzoekers uit. Immers, de meeste antibiotica die in de geneeskunde worden gebruikt, worden in de eerste plaats geïsoleerd van bodemmicro-organismen, zoals bacteriën of schimmels. Dat betekent dat de resistentiegenen beschikbaar waren lang voordat mensen antibiotica in gebruik namen. Bacteriën waar ze om beginnen, kunnen ze eenvoudig lenen (via horizontale overdracht van genen) van degenen die beter zijn uitgerust.

Nesme en Simonet zeggen dat de nieuwe bevindingen moeten komen als een pleidooi voor een breder ecologisch perspectief op het antibioticaresistentieprobleem.

"Alleen met meer kennis over de verspreiding van antibiotica-resistentie - van de omgeving tot ziekteverwekkers in de kliniek en het falen van antibiotica-behandelingen - zullen we duurzamere antibiotica kunnen produceren", zegt Nesme.

advertentie



Verhaal Bron:

Materiaal geleverd door Cell Press . Opmerking: inhoud kan worden bewerkt voor stijl en lengte.


Journal Reference :

  1. Joseph Nesme, Sébastien Cécillon, Tom O. Delmont, Jean-Michel Monier, Timothy M. Vogel, Pascal Simonet. Grootschalige, opagenomaat-gebaseerde studie van antibioticaresistentie in de omgeving . Huidige biologie, 2014; DOI: 10.1016 / j.cub.2014.03.036